Если ввести иммунокомпетентные клетки реципиенту, отличающемуся от донора по трансплантационным антигенам, но не способному к отторжению этих клеток, они могут реагировать на антигены реципиента и вызывать процесс, называемый реакцией «трансплантат против хозяина» (РТПХ). Реципиент может не отторгать трансплантат по различным причинам. Отметим следующие из них: а) иммунодепрессия в результате облучения или химиотерапии, б) незрелость иммунной системы; так, новорожденные животные, иммунная система которых еще не достигла полного развития, более чувствительны к РТПХ, чем взрослые, в) генетически детерминированная ареактивность, такая, например, как неспособность гибридов Fx отторгать трансплантаты от родителей.

РТПХ инициируется реактивностью трансплантированных иммунокомпе-тентных клеток, направленной против антигенов гистосовместимости реципиента (хозяина). Однако эта реакция, несомненно, вовлекает также компоненты иммунной системы хозяина. Клинические проявления реакции —это гипертрофия целого ряда гемопоэтических и лимфопоэтических тканей, кожная сыпь, кишечные расстройства и другие симптомы аллергического характера. Нередко считают, что РТПХ является аналогом in vivo описанной ранее реакции СКЛ.
Хотя наиболее сильным стимулятором РТПХ является несовместимость по МНС, другие локусы гистосовместимости также способны вызывать эту реакцию. Именно ввиду последней причины РТПХ остается главной помехой на пути трансплантации костного мозга у человека, даже если донор и реципиент являются сибсами, идентичными по HLA.